Xavier Daura: шукати на сайті Z-Library

Haibo Yu, Xavier Daura, Wilfred F. van Gunsteren

Рік:

2001

Мова:

english

Файл:

PDF, 45 KB

english, 2001

Molecular dynamics simulations of peptides containing an unnatural amino acid: Dimerization, folding, and protein binding

Журнал:

Journal of Archaeological Science: Reports

Рік:

2004

Мова:

english

Файл:

PDF, 298 KB

english, 2004

Deciphering Neolithic activities from a Cardial burial site (Cova Bonica) on the western Mediterranean coast

Daura, Joan, Sanz, Montserrat, Oms, F. Xavier, Pedro, Mireia, Martínez, Pablo, Mendiela, Susana, Oliva Poveda, Mònica, Gibaja, Juan F., Mozota, Millán, Alonso-Eguíluz, Mónica, Albert, Rosa M., Allué,

Журнал:

Рік:

2019

Файл:

PDF, 9.21 MB

2019

Parametrization of aliphatic CHn united atoms of GROMOS96 force field

Daura, Xavier, Mark, Alan E., Van Gunsteren, Wilfred F.

Журнал:

Daura, Xavier, Oliva, Baldomero, Querol, Enrique, Avilés, Francesc X., Tapia, Orlando

Рік:

1998

Мова:

english

Файл:

PDF, 203 KB

english, 1998

On the sensitivity of MD trajectories to changes in water-protein interaction parameters: The potato carboxypeptidase inhibitor in water as a test case for the GROMOS force field

Журнал:

Xavier Daura, Wilfred F. van Gunsteren, Alan E. Mark

Рік:

1996

Мова:

english

Файл:

PDF, 1.39 MB

english, 1996

Folding–unfolding thermodynamics of a β-heptapeptide from equilibrium simulations

Журнал:

Рік:

1999

Мова:

english

Файл:

PDF, 530 KB

english, 1999

The effect of motional averaging on the calculation of NMR-derived structural properties

Xavier Daura, Iris Antes, Wilfred F. van Gunsteren, Walter Thiel, Alan E. Mark

Журнал:

Рік:

1999

Мова:

english

Файл:

PDF, 323 KB

english, 1999

Peptidfaltung: Wenn die Simulation das Experiment erreicht

Xavier Daura, Karl Gademann, Bernhard Jaun, Dieter Seebach, Wilfred F. van Gunsteren, Alan E. Mark

Журнал:

Рік:

1999

Мова:

german

Файл:

PDF, 206 KB

german, 1999

Peptide Folding: When Simulation Meets Experiment

Xavier Daura, Karl Gademann, Bernhard Jaun, Dieter Seebach, Wilfred F. van Gunsteren, Alan E. Mark

Журнал:

Dieter Seebach, Jürg V. Schreiber, Stefan Abele, Xavier Daura, Wilfred F. van Gunsteren

Рік:

1999

Мова:

english

Файл:

PDF, 214 KB

english, 1999

Structure and Conformation of β-Oligopeptide Derivatives with Simple Proteinogenic Side Chains: Circular Dichroism and Molecular Dynamics Investigations

Журнал:

Heiko Schäfer, Xavier Daura, Alan E. Mark, Wilfred F. van Gunsteren

Рік:

2000

Мова:

english

Файл:

PDF, 362 KB

english, 2000

Entropy calculations on a reversibly folding peptide: Changes in solute free energy cannot explain folding behavior

Журнал:

Wilfred F. van Gunsteren, Roland Bürgi, Christine Peter, Xavier Daura

Рік:

2001

Мова:

english

Файл:

PDF, 304 KB

english, 2001

Der Schlüssel zum Verständnis des Proteinfaltungsproblems liegt in der richtigen Beschreibung des denaturierten Zustandes

Журнал:

Рік:

2001

Мова:

german

Файл:

PDF, 303 KB

german, 2001

Buchbesprechung: Protein Structure Prediction. Methods and Protocols (Methods in Molecular Biology, Vol. 143). Herausgegeben von David M. Webster

Xavier Daura

Журнал:

Wilfred F. van Gunsteren, Roland Bürgi, Christine Peter, Xavier Daura

Рік:

2001

Мова:

german

Файл:

PDF, 45 KB

german, 2001

Reply

Журнал:

Wilfred F. van Gunsteren, Roland Bürgi, Christine Peter, Xavier Daura

Рік:

2001

Мова:

english

Файл:

PDF, 53 KB

english, 2001

The Key to Solving the Protein-Folding Problem Lies in an Accurate Description of the Denatured State

Журнал:

Wilfred F. van Gunsteren, Roland Bürgi, Christine Peter, Xavier Daura

Рік:

2001

Мова:

english

Файл:

PDF, 299 KB

english, 2001

Reply

Журнал:

Werngard Czechtizky, Xavier Daura, Andrea Vasella, Wilfred van Gunsteren

Рік:

2001

Мова:

english

Файл:

PDF, 53 KB

english, 2001

Oligonucleotide Analogues with a Nucleobase-Including Backbone, Part 7, Molecular Dynamics Simulation of a DNA Duplex Containing a 2′-Deoxyadenosine 8-(Hydroxymethyl)-Derived Nucleotide

Журнал:

Wilfred F. van Gunsteren, Xavier Daura, Alan E. Mark

Рік:

2001

Мова:

english

Файл:

PDF, 320 KB

english, 2001

Computation of Free Energy

Журнал:

Riccardo Baron, Dirk Bakowies, Wilfred F. van Gunsteren, Xavier Daura

Рік:

2002

Мова:

english

Файл:

PDF, 162 KB

english, 2002

β-Peptides with Different Secondary-Structure Preferences: How Different Are Their Conformational Spaces?

Журнал:

Рік:

2002

Мова:

english

Файл:

PDF, 468 KB

english, 2002

Stability of SIV gp32 Fusion-Peptide Single-Layer Protofibrils as Monitored by Molecular-Dynamics Simulations

Patricia Soto, Josep Cladera, Alan E. Mark, Xavier Daura

Журнал:

Рік:

2005

Мова:

english

Файл:

PDF, 185 KB

english, 2005

Biomolekulare Modellierung: Ziele, Probleme, Perspektiven

Wilfred F. van Gunsteren, Dirk Bakowies, Riccardo Baron, Indira Chandrasekhar, Markus Christen, Xavier Daura, Peter Gee, Daan P. Geerke, Alice Glättli, Philippe H. Hünenberger, Mika A. Kastenholz, Chr

Журнал:

Рік:

2006

Мова:

german

Файл:

PDF, 2.67 MB

german, 2006

Stability of SIV gp32 Fusion-Peptide Single-Layer Protofibrils as Monitored by Molecular-Dynamics Simulations

Patricia Soto, Josep Cladera, Alan E. Mark, Xavier Daura

Журнал:

Рік:

2005

Мова:

english

Файл:

PDF, 185 KB

english, 2005

Biomolecular Modeling: Goals, Problems, Perspectives

Журнал:

Sofía Calero, Santiago Lago, Wilfred F. van Gunsteren, Xavier Daura

Рік:

2006

Мова:

english

Файл:

PDF, 2.03 MB

english, 2006

The rheumatoid arthritis–associated allele HLA–DR10 (DRB11001) shares part of its repertoire with HLA–DR1 (DRB10101) and HLA–DR4 (DRB*0401)

Iñaki Alvarez, Javier Collado, Xavier Daura, Nuria Colomé, Marta Rodríguez-García, Teresa Gallart, Francesc Canals, Dolores Jaraquemada

Журнал:

Arthritis & Rheumatism

Рік:

2008

Мова:

english

Файл:

PDF, 819 KB

english, 2008

Modelling of the Complex between a 15-Residue Peptide from mSos2 and the N-Terminal SH3 Domain of Grb2 by Molecular-Dynamics Simulation

Журнал:

Chemistry & Biodiversity

Рік:

2004

Мова:

english

Файл:

PDF, 287 KB

english, 2004

Molecular-Dynamics Simulations of C- and N-Terminal Peptide Derivatives of GCN4-p1 in Aqueous Solution

John H. Missimer, Michel O. Steinmetz, Wolfgang Jahnke, Fritz K. Winkler, Wilfred F. van Gunsteren, Xavier Daura

Журнал:

Chemistry & Biodiversity

Рік:

2005

Мова:

english

Файл:

PDF, 721 KB

english, 2005

Studying the Stability of a Helical β-Heptapeptide by Molecular Dynamics Simulations

Xavier Daura, Wilfred F. van Gunsteren, Dario Rigo, Bernhard Jaun, Dieter Seebach

Журнал:

Chemistry - A European Journal

Рік:

1997

Мова:

english

Файл:

PDF, 1.47 MB

english, 1997

On the Influence of Charged Side Chains on the Folding–Unfolding Equilibrium of β-Peptides: A Molecular Dynamics Simulation Study

Alice Glättli, Xavier Daura, Pascal Bindschädler, Bernhard Jaun, Yogesh R. Mahajan, Raveendra I. Mathad, Magnus Rueping, Dieter Seebach, Wilfred F. van Gunsteren

Журнал:

Chemistry - A European Journal

Рік:

2005

Мова:

english

Файл:

PDF, 1.69 MB

english, 2005

Estimating the Temperature Dependence of Peptide Folding Entropies and Free Enthalpies from Total Energies in Molecular Dynamics Simulations

Ricard Boned, Wilfred F. van Gunsteren, Xavier Daura

Журнал:

Chemistry - A European Journal

Рік:

2008

Мова:

english

Файл:

PDF, 388 KB

english, 2008

ChemInform Abstract: Structure and Conformation of β-Oligopeptide Derivatives with Simple Proteinogenic Side Chains: Circular Dichroism and Molecular Dynamics Investigations.

Dieter Seebach, Juerg V. Schreiber, Stefan Abele, Xavier Daura, Wilfred F. van Gunsteren

Журнал:

ChemInform

Рік:

2000

Файл:

PDF, 28 KB

2000

ChemInform Abstract: Oligonucleotide Analogues with a Nucleobase-Including Backbone. Part 7. Molecular Dynamics Simulation of a DNA Duplex Containing a 2′-Deoxyadenosine 8-(Hydroxymethyl)-Derived Nucleotide.

Werngard Czechtizky, Xavier Daura, Andrea Vasella, Wilfred van Gunsteren

Журнал:

ChemInform

Рік:

2001

Файл:

PDF, 27 KB

2001

On the Relative Merits of Equilibrium and Non-Equilibrium Simulations for the Estimation of Free-Energy Differences

Prof. Xavier Daura, Dr. Roman Affentranger, Prof. Alan E. Mark

Журнал:

ChemPhysChem

Рік:

2010

Мова:

english

Файл:

PDF, 456 KB

english, 2010

α-Cyclodextrin Host–Guest Binding: A Computational Study of the Different Driving Forces

Sereina Riniker, Xavier Daura, Wilfred F. van Gunsteren

Журнал:

Alice Glättli, Xavier Daura, Wilfred F. Van Gunsteren

Рік:

2010

Мова:

english

Файл:

PDF, 400 KB

english, 2010

A novel approach for designing simple point charge models for liquid water with three interaction sites

Журнал:

Lukas D. Schuler, Xavier Daura, Wilfred F. van Gunsteren

Рік:

2003

Мова:

english

Файл:

PDF, 166 KB

english, 2003

An improved GROMOS96 force field for aliphatic hydrocarbons in the condensed phase

Журнал:

Roman Affentranger, Xavier Daura

Рік:

2001

Мова:

english

Файл:

PDF, 190 KB

english, 2001

Polypeptide folding on a conformational-space network: Dependence of network topology on the structural discretization procedure

Журнал:

Alex Bayés, Anka Sonnenschein, Xavier Daura, Josep Vendrell, Francesc X. Aviles

Рік:

2010

Мова:

english

Файл:

PDF, 494 KB

english, 2010

Procarboxypeptidase A from the insect pest Helicoverpa armigera and its derived enzyme : Two forms with new functional properties

Журнал:

FEBS Journal

Рік:

2003

Мова:

english

Файл:

PDF, 287 KB

english, 2003

Assessing the structural conservation of protein pockets to study functional and allosteric sites: implications for drug discovery

Alejandro Panjkovich, Xavier Daura

Журнал:

BMC Structural Biology

Рік:

2010

Мова:

english

Файл:

PDF, 1.69 MB

english, 2010

Assessing equilibration and convergence in biomolecular simulations

Lorna J. Smith, Xavier Daura, Wilfred F. van Gunsteren

Журнал:

Tsjerk A. Wassenaar, Xavier Daura, Esteve Padrós, Alan E. Mark

Рік:

2002

Мова:

english

Файл:

PDF, 560 KB

english, 2002

Calcium binding to the purple membrane: A molecular dynamics study

Журнал: